Myllypurossa on hyvät liikenneyhteydet. Julkinen liikenne sujuu nopeasti ja vaivattomasti metrolla. Kehä I:tä ja Viilarintietä pitkin kulkevat poikittaislinjojen bussit.
Myllypuro sijaitsee metron ja Kehä I:n varrella. Metrolla matka Myllypuron keskustasta Helsingin keskustaan kestää noin 16 minuuttia.
Metron lisäksi Myllypurosta kulkee bussilinjoja keskustaan ja poikittaiset runkolinjat 560 ja 550 sekä rakennettava Raide-Jokeri palvelevat nekin joitain osia Myllypurosta.
Palvelukeskuksen ja terveysaseman yhteydessä on runsaasti pysäköintitilaa. Pelkästään liityntäpysäköintiä varten on 43 autopaikkaa pysäköintilaitokseen palvelukeskuksen alla.
Myllypuron Kehä I:n eritasoliittymän tiesuunnitelma on valmistunut 2015. Hankkeen valmistelu etenee yhteistyössä valtion kanssa. Eritasoliittymän toteuttaminen on ajoitettu kaupungin investointiohjelmassa vuosille 2020–2022.